Рабочие окружения

Поиск и анализ вариаций геномов

Подготовка данных и контроль качества

  • Импортировать данные
    Вы можете загрузить ваши файлы FASTQ через браузер или по FTP

  • Контроль качества данных секвенирования
    Выполняет контроль качества ваших данных

  • EA Utils trim and clip
    Отмечает присутствие адаптерных последовательностей,
    вычисляет вероятное положение (начало и конец) адаптеров
    Удаляет адаптерные последовательности из файлов FASTQ

  • FastX clip
    Отрезает адаптеры с 3' конца последовательностей в FASTA/FASTQ файлах

 

Сценарии обработки данных

Попробуйте сценарий автоматической обработки данных

Картирование прочтений на референсный геном

 

Аннотация геномных вариациий

Рабочие окружения