Анализ ДНК и РНК
Набор наиболее часто используемых методов для контроля качества генетических данных,
их первичной подготовки (удаление адаптеров, ПЦР дупликатов) и выравнивания на геном.
- Загрузка данных
- Контроль качества
-
FASTQC
Контроль качества FASTQ файлов
- Удаление адаптеров
-
Cutadapt
Удаление адаптерных последовательностей, обрезание концов прочтений,
фильтрация прочтений низкого качества и недостаточной длины
- Выравнивание прочтений на референсный геном
- Оценка качества выравнивания